Po oddaleniu się ze stolicy Nicefor skierował się na tereny pustynne. Tam odnalazł jaskinie w skale. Była ona pusta, widać było po niej, że dawno została opuszczona przez jakieś dzikie zwierzę. Za pożywienie służyć mu miały dwa bochenki czerstwego chleba oraz bukłak napełniony wodą. Pustelnik Nicefor postanowił oddać się modlitwie i rozmyślaniu o życiu. Pobyt w pustelni rozpoczął od modlitwy do Ducha Świętego o pomoc i Jego dary, szczególnie, że dziś jest Uroczystość Zesłania Ducha Świętego.
